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在实际临床诊断中，医生往往很难区分花粉症是单一过敏、共同致敏还是交叉致敏。因此，开展过敏原组分鉴定能为临床治疗提供更有价值的参考。我国已有学者就此开展了相关研究。例如，广州医科大学附属第一医院变态反应科免疫室主任孙宝清团队，分析了PR-10蛋白、肌动蛋白等树花粉的主要过敏原，以及可能导致花粉食物过敏综合征的交叉反应组分。团队认为，过敏原组分诊断有助于帮助患者更有针对性地选择过敏原进行特异性免疫治疗，提高治疗效果。
有研究者指出，随着分子生物学及基因组、蛋白组学技术的高速发展，越来越多的过敏原蛋白得到鉴定。在此背景下，全球很多机构建立了不同类型的过敏原数据库。例如美国健康与环境科学研究所协调组织国际合作团队，建立了过敏原综合数据库COMPARE，通过高通量序列分选算法，结合专家人工审核方法，从各个公共蛋白质数据库、其他过敏原数据库以及相关文献中筛选过敏原，为基础和临床研究人员等提供参考。
药物治疗是花粉过敏的主要治疗方法之一，常用药物包括口服抗组胺药物及白三烯受体拮抗剂、鼻喷激素、鼻喷抗组胺药等。近年来， 维生素D缺乏和肠道菌群紊乱与过敏性疾病的关系受到广泛关注。维生素D缺乏或可增加过敏性疾病的发生概率或使患者症状加重。此外相关研究发现，益生菌辅助治疗过敏性哮喘，可以使患者更大获益。
变应原特异性免疫治疗即脱敏治疗，是世界卫生组织推荐的唯一可能影响过敏性疾病自然进程、改变免疫应答机制的对因疗法。其原理是先给予低剂量过敏原药物KCCH.VIP，再逐渐增加剂量，达到足够疗程之后，使患者免疫系统趋于正常，逐渐适应外界过敏原，从而避免过敏症状出现。脱敏治疗包括皮下注射和舌下含服两种方式。2014年，美国食品药品监督管理局批准上市了豚草花粉过敏原提取物制成的舌下免疫治疗药物。目前，我国针对黄花蒿花粉过敏原的舌下免疫治疗产品也已应用于临床。
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